Окончила Московскую государственную консерваторию им. Чайковского и аспирантуру в классе профессора, заслуженного деятеля РФ Ю.Должикова. Лауреат Всесоюзного и международных конкурсов, среди которых - Всесоюзный конкурс (II премия, Воронеж, 1991), лауреат Межрегионального конкурса (1 премия, Кыргызстан, 1993), лауреат Международного конкурса (1 премия, Казахстан, 1994), лауреат Международного конкурса камерных ансамблей в г. Казани, в составе квартета флейт «Сиринкс» (1 флейта, 2000), лауреат международного конкурса «Шабыт» в г. Астана (I премия), участница международного конкурса им.Нильсена в Дании, участница международных фестивалей
«Eurochestria» Франция и "Душа Японии» Россия и международного фестиваля посвященного памяти выдающегося флейтиста - педагога Ю.Должикова. Балжан Сапарова много лет работала в различных оркестрах России, в том числе Государственном симфоническом оркестре ' радио и тв" рф, работала концертмейстером группы флейт в Государственном академическом симфоническом оркестре Казахстана, сейчас является солисткой оркестра театра «Астана опера». Успешно совмещает преподавательскую деятельность, вначале в Казахской национальной консерватории им. Курмангазы, сейчас в Казахском национальном университете искусств, где успешно ведет класс флейты.
Член жюри 44-го Республиканского конкурса, международного конкурса «Салют талантов», международного конкурса «My flute». Балжан почти 30 лет ведет активную творческую жизнь не только на родине, но и далеко за ее пределами. Например, в 1995 г.– концерты с программой «Новые имена» посвященные 50‐летию ООН (Париж) и 50‐летию ЮНЕСКО (Женева). С ГАСО РК исполнила концерты для флейты Ж.Ибера (2009), К.Ф.Э Баха (2007), Тарантелла К. Сен‐Санса для флейты с кларнетом (2012), И. Мошелеса концертино для флейты и гобоя (2007,2012).
С оркестром театра «Астанаопера» (2014-2021) Д.Бизе- Борн - Фантазия на темы из оперы «Кармэн», И. Меркаданте Концерт е-moll, Ж.Ибер - Концерт, И.Допплер фантазия на темы из оперы «Риголетто» и др.
C симфоническим оркестром «Антонио» «Тройной Концерт» Т.Кажгалиева в концертном зале «Оркестрион» в Москве (2017), «Сюита» А.Кажгалиевой (специально написанная для Балжан) в Малом зале Московской консерватории (2022)
С Президентским оркестром Кыргызстана «Манас», концерт К.Ф.Э.Баха и сюита И.С.Баха (2022г.) и др.